Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms