Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TCIRG1Q13488 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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