Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
STX4Q12846 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
STX4Q12846 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms