Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.4 ms