Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREMQ03060 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREMQ03060 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms