Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms