Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms