Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms