Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms