Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NMUP48645 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NMUP48645 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms