Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MDH1P40925 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MDH1P40925 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MDH1P40925 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MDH1P40925 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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