Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

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Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXC8P31273 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC8P31273 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms