Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms