Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DSPP15924 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DSPP15924 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DSPP15924 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms