Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINOS1-NBL1R4GNA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MINOS1-NBL1R4GNA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms