Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms