Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF3B6Q9Y3B4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms