Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFSF13BQ9Y275 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFSF13BQ9Y275 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFSF13BQ9Y275 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms