Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCML2Q9UQR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCML2Q9UQR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCML2Q9UQR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms