Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC3Q9UQE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMC3Q9UQE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms