Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHOC2Q9UQ13 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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