Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PADI4Q9UM07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI4Q9UM07 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms