Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMFRQ9UKV5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMFRQ9UKV5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMFRQ9UKV5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms