Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms