Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO3A1Q9UIG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO3A1Q9UIG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms