Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCDC2Q9UHG0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCDC2Q9UHG0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCDC2Q9UHG0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms