Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTNAP2Q9UHC6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP2Q9UHC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms