Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC3Q9UHC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC3Q9UHC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms