Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms