Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPNE7Q9UBL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPNE7Q9UBL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms