Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPR1Q9UBH6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms