Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN3Q9P232 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN3Q9P232 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms