Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC88CQ9P219 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms