Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR4Q9NYA4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR4Q9NYA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms