Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA8Q9NY65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA8Q9NY65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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