Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A12Q9NXJ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A12Q9NXJ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms