Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 MROH6-204ENST00000532704 424 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 APOL2-209ENST00000529194 611 ntTSL 39.88□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 APOL2-204ENST00000454728 577 ntTSL 48.8□□□□□ -12e-7■■■■■ 36.6
RBM22Q9NW64 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 323.83■■□□□ 1.412e-12■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.092e-12■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-12■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-12■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 36.96□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 54.17□□□□□ -1.746e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 RBM39-226ENST00000468086 549 ntTSL 41.22□□□□□ -2.216e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 RBM39-228ENST00000471635 549 ntTSL 20.92□□□□□ -2.266e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 220.17■□□□□ 0.826e-10■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.456e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.456e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 411.93□□□□□ -0.56e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.76e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 510.58□□□□□ -0.726e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 29.98□□□□□ -0.816e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 49.39□□□□□ -0.916e-9■■■■■ 36.5
RBM22Q9NW64 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -14e-11■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 37.17□□□□□ -1.264e-11■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 210.9□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.59□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.316e-15■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PABPC4-216ENST00000492468 2257 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PABPC4-206ENST00000437136 876 ntTSL 511.83□□□□□ -0.521e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PABPC4-209ENST00000468476 3592 ntTSL 29.03□□□□□ -0.961e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 28.05□□□□□ -1.121e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 27.53□□□□□ -1.21e-12■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.584e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-204ENST00000451734 559 ntTSL 317.41■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 WNK2-212ENST00000467401 2258 ntTSL 217.37■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 WNK2-209ENST00000460335 559 ntTSL 317.12■□□□□ 0.334e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-211ENST00000438799 976 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-213ENST00000450367 1030 ntTSL 510.82□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-205ENST00000477693 1096 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-218ENST00000491715 773 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-209ENST00000423280 959 ntTSL 29.13□□□□□ -0.954e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.144e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-216ENST00000479821 213 ntTSL 57.43□□□□□ -1.224e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.34e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.434e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 MTAP-206ENST00000577563 339 ntTSL 1 (best)4.09□□□□□ -1.754e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-202ENST00000423105 686 ntTSL 33.66□□□□□ -1.824e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-203ENST00000447132 759 ntTSL 1 (best)3.14□□□□□ -1.914e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 NIFK-206ENST00000481978 663 ntTSL 22.89□□□□□ -1.954e-9■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 SSUH2-215ENST00000492435 538 ntTSL 418.77■□□□□ 0.67e-7■■■■■ 36.4
RBM22Q9NW64 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 AKAP8L-213ENST00000597994 470 ntTSL 411.31□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.115e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 SUN2-208ENST00000438058 1012 ntTSL 322.93■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 28.58□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 STIL-206ENST00000418131 3417 ntTSL 25.14□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 36.3
RBM22Q9NW64 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.751e-13■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.747e-8■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-8■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 36.2
RBM22Q9NW64 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 COQ4-203ENST00000461102 3127 ntTSL 211.46□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 KMT2E-204ENST00000468607 558 ntTSL 21.41□□□□□ -2.189e-7■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 ATAD2-208ENST00000550993 438 ntTSL 36.81□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 36.1
RBM22Q9NW64 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 36
RBM22Q9NW64 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.356e-9■■■■■ 36
RBM22Q9NW64 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 36
RBM22Q9NW64 ADGRV1-208ENST00000509621 5211 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 36
RBM22Q9NW64 ADGRV1-231ENST00000640374 5401 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 36
RBM22Q9NW64 WAC-210ENST00000439676 2762 ntTSL 54.84□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 36
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 487.9 ms