Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR3EQ9NVU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR3EQ9NVU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR3EQ9NVU0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms