Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM140Q9NV12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms