Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAMSN1Q9NSI8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMSN1Q9NSI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms