Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPRMQ9NS64 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPRMQ9NS64 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPRMQ9NS64 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms