Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHPT1Q9NRX4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms