Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRC4Q9NPP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRC4Q9NPP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRC4Q9NPP4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms