Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FANCFQ9NPI8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FANCFQ9NPI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FANCFQ9NPI8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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