Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MID1IP1Q9NPA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID1IP1Q9NPA3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID1IP1Q9NPA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID1IP1Q9NPA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID1IP1Q9NPA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MID1IP1Q9NPA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms