Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC28A3Q9HAS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms