Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX17Q9H6I2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX17Q9H6I2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX17Q9H6I2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms