Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PIF1Q9H611 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms