Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL4Q9C0H6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms