Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INO80BQ9C086 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INO80BQ9C086 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms